スーパーコンピュータシステム 一式
基本情報
- 調達機関および所在地
- 大学共同利用機関法人 (静岡県)
- 公示日
- 2017年12月01日
- 公示の種類
- 資料提供招請に関する公表
- 機関名詳細および所在地詳細
- 大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構 機構長 藤井 良一
詳細情報
次のとおり物品の導入を予定していますので、当該導入に関して資料等の提供を招請します。 平成 29 年 12 月1日 大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構 機構長 藤井 良一 ◎調達機関番号 416 ◎所在地番号 22 ○第1号―遺伝研 1 調達内容 (1) 品目分類番号 14 (2) 導入計画物品及び数量 スーパーコンピュータシステム 一式 (3) 調達方法 借入 (4) 導入目的 遺伝研スーパーコンピュータは、(i)国際塩基配列データベース(INSD)構築のための計算機資源 (ii)大学共同利用機関として遺伝学を中心とした生命・医学系の研究者への計算機資源の提供を目的に運用される。新システムでは現行の事業を継続しつつ、近年のデータ量の急激な増加に伴うユーザの増加、計算資源に対する要求の増大に対応する。 (5) 導入予定時期 平成30年度2月以降 (6) 調達に必要とされる基本的な要求要件 A 本システムは、分散記憶型並列計算機を構成する計算ノード、大容量高速ストレージシステム、およびこれらを接続するノード間相互接合網、停電対策のためのUPS装置、空調装置などからなる。伝統的ジョブスケジューリングシステムによる管理に加えてApache Mesosを用いたビッグデータ解析基盤を構築する。個人ゲノムの管理に適したセキュリティーシステムの提案を歓迎する。 B 設置場所は遺伝研電子計算機棟2F及び3F計算機室とする。3Fは空調機の入れ替えが必要である。また、物理セキュリティ強化のための設備工事が必要である。提案者は施設説明会(日程は導入説明会にて説明)により現地を確認し適切な方法を提案すること。 C 計算ノードはCPUソケット数、主記憶容量などが異なる2種類の計算ノード(Thin, Medium)から構成される。計算ノード内のすべてのCPUはx86_64の命令体系を有すること。 D 本システムはそれぞれ2基以上のCPUを搭載した384台のThin計算ノードを備えること。Thin計算ノードはCPUソケットあたり6以上のメモリチャネルを有し、CPUソケットあたり256GB以上のメモリを搭載すること。384台のThin計算ノードのうち128台についてはそれぞれの計算ノードの倍精度演算ピーク性能は合算で2,048GFLOPS以上であること。残り256台のThin計算ノードについてはCPU単体の倍精度演算ピーク性能は512GFLOPS以上、Thin計算ノードのSPECint_rate_base2006が1,840以上であること。この256台のThin計算ノードのうちの128台については、それぞれ4TB以上のSSDをNVMeポートに搭載すること。 E Medium計算ノードはノードあたり6TB以上のCPUメモリを持つこと。初回導入時10ノード以上で構成すること。 F 各Thin計算ノード及びMedium計算ノードはノード間相互接合網に対して40Gbps以上の帯域幅で接続すること。 G 大容量高速ストレージシステムは、非フォーマット時で15PB以上の物理容量を有すること。高速かつ高信頼な並列ファイルシステムを有すること。 H 本スーパーコンピュータシステムのノード間相互接合網はファイアウォール装置を介して10GbE×4で外部ネットワーク(SINET5)に接続すること。 2 資料及びコメントの提供方法 上記1(2)の物品に関する一般的な参考資料及び同(6)の要求要件等に関するコメント並びに提供可能なライブラリーに関する資料等の提供を招請する。 (1) 資料等の提供期限 平成30年1月19日 (2018年1月19日)17時15分(郵送の場合は必着のこと。) (2) 提供先 〒411―8540三島市谷田1111 📍 大学共同利用機関法人 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所管理部財務課調達チーム 渡辺 晃 電話055―981―6730 3 説明書の交付 本公表に基づき応募する供給者に対して導入説明書を交付する。 (1) 交付期間 平成29年12月1日 (2017年12月1日)から平成30年1月19日 (2018年1月19日)まで。 (2) 交付場所 上記2(2)に同じ。 4 説明会の開催 本公表に基づく導入説明会を開催する。 (1) 開催日時 平成29年12月8日 (2017年12月8日)14時00分 (2) 開催場所 国立遺伝学研究所本館2階会議室 5 その他 この導入計画の詳細は導入説明書による。なお、本公表内容は予定であり、変更することがあり得る。