スーパーコンピュータシステム 一式
基本情報
- 調達機関および所在地
- 国立大学法人 (京都府)
- 公示日
- 2014年08月06日
- 公示の種類
- 資料提供招請に関する公表
- 機関名詳細および所在地詳細
- 国立大学法人京都大学長 松本 紘
詳細情報
次のとおり物品の導入を予定していますので、当該導入に関して資料等の提
供を招請します。
平成 26 年8月6日
国立大学法人京都大学長 松本 紘
◎調達機関番号 415 ◎所在地番号 26
○第1号
1 調達内容
(1) 品目分類番号 14
(2) 導入計画物品及び数量
スーパーコンピュータシステム 一式
(3) 調達方法 借入
(4) 導入目的 本システムは、本学における、化学を中心とした自然科
学・工学の広範な分野での大規模計算、バイオインフォマティクスを中心とし
た生命科学研究の推進、及びゲノムネット運用のために導入するものである。
(5) 導入予定時期 平成27年度1月以降
(6) 調達に必要とされる基本的な要求要件
A 現在化学研究所が使用しているスーパーコンピュータシステムは、ゲ
ノムネット計算サーバ及び化学計算サーバ(ともにSGI UV1000)、
ゲノムネットウェブサーバ及びゲノムネット開発サーバ(ともにOracle
Sun Fire X4800)、化学データベースサーバ(SGI UV
10等)、ファイルサーバ(Oracle Sun SPARC M4000
)、ネットワークディスク装置(NetApp FAS6240)から構成さ
れ、UNIX環境で運用されている。今回導入予定のスーパーコンピュータシ
ステムは、現在使用しているスーパーコンピュータシステムを次世代のゲノム
解析に対応するために拡張したものであり、以下に示す6つのサーバと2つの
ディスクシステムから構成され、UNIX環境で運用できること。
B ゲノムネット計算サーバ:2つのシステムAとBからなること。シス
テムAは、1,024以上のCPUコアを持ち、共有メモリ方式で32TB以
上の主記憶容量があること。960TB以上の高速磁気ディスク装置を備えて
いること。システムBは、16以上のCPUコアを持つ128以上のノードか
らなること。各ノードはそれぞれが共有メモリ方式で256GB以上の主記憶
容量を備えていること。システムA、Bともに、計算生物学関連、特にゲノム
解析関連のソフトウェアが整備されていること。
C 化学計算サーバ:16以上のCPUコアを持つ96以上のノードから
なり、そのうち12以上のノードにはGPUが搭載されていること。各ノード
はそれぞれが共有メモリ方式で256GB以上の主記憶容量を備えていること
。各ノード間は10Gbps以上のネットワークで接続されていること。また
、複数ノードによるMPI並列計算が可能であること。計算化学関連のソフト
ウェアが整備されていること。
D ゲノムネットウェブサーバ:64以上のCPUコアを持つ6つ以上の
ノードからなること。各ノードはそれぞれが共有メモリ方式で512GB以上
の主記憶容量を備えていること。
E ゲノムネット開発サーバ:64以上のCPUコアを持つ4つ以上のノ
ードからなること。各ノードはそれぞれが共有メモリ方式で512GB以上の
主記憶容量を備えていること。
F 化学データベースサーバ:8以上のCPUコアを持つ8つ以上のノー
ドからなること。各ノードはそれぞれが共有メモリ方式で128GB以上の主
記憶容量を備えていること。化学データベース及びリレーショナルデータベー
スシステムを提供すること。
G ファイルサーバ:16以上のCPUコアを持つ10以上のノードから
なること。各ノードはそれぞれが共有メモリ方式で128GB以上の主記憶容
量を備えていること。ユーザのファイルシステム以外にネームサーバ、メール
サーバ、ウェブサーバとしての機能を備えること。
H ネットワークディスク装置は、4PB以上の大容量ネットワークファ
イルシステムと3PB以上の高速アクセス用分散ファイルシステムからなるこ
と。
I これら6つのサーバと2つのディスク装置は10Gbps 以上の二
重の高速ネットワークで接続されていること。外部からのアクセス用にファイ
アウォールとVPN装置を備えること。これら6つのサーバ、2つのディスク
装置、ネットワーク装置は無停電電源装置に接続されており、5分程度の瞬間
停電時にもシステムの継続運用が可能なこと。
2 資料及びコメントの提供方法 上記1(2)の物品に関する一般的な参考
資料及び同(6)の要求要件等に関するコメント並びに提供可能なライブラリ
ーに関する資料等の提供を招請する。
(1) 資料等の提供期限 平成26年9月17日 (2014年9月17日)17時00分(郵送の場
合は必着のこと。)
(2) 提供先 〒611―0011 宇治市五ケ庄 京都大学宇治地区事
務部経理課調達・経理掛 田中 義郎 電話0774―38―3378
3 説明書の交付 本公表に基づき応募する供給者に対して導入説明書を交付
する。
(1) 交付期間 平成26年8月6日 (2014年8月6日)から平成26年9月17日 (2014年9月17日)まで。
(2) 交付場所 上記2(2)に同じ。
4 説明会の開催 本公表に基づく導入説明会を開催する。
(1) 開催日時 平成26年8月20日 (2014年8月20日)14時00分
(2) 開催場所 京都大学化学研究所会議室
5 その他 この導入計画の詳細は導入説明書による。なお、本公表内容は予
定であり、変更することがあり得る。