次のとおり物品の導入を予定していますので、当該導入に関して資料等の提 供を招請します。　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　 　平成　２２　年９月　１３　日　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　 　　　　　　　大学共同利用機関法人　　　　　　　　　　　　　　　　　　 　　　　　　　　　情報・システム研究機構　　　　　　　　　　　　　　　 　　　　　　　　　　　　機構長　堀田　凱樹　　　　　　　　　　　　　　 ◎調達機関番号　４１６　◎所在地番号　２２　　　　　　　　　　　　　　 ○第１号−遺伝研　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　 １　調達内容　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　 　（１）　品目分類番号　１４　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　 　（２）　導入計画物品及び数量　スーパーコンピュータシステム　一式　　 　（３）　調達方法　借入　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　 　（４）　導入目的　遺伝学研究所のスーパーコンピュータシステムは、〓国 際ＤＮＡデータベース事業のアジア拠点機能の提供、〓バイオインフォーマテ ィックスセンターとして実験研究者への解析環境の提供、〓理論研究者への計 算資源の提供を３つの柱とするサービスの提供を行ってきた。　　　　　　　 　　　そのための設備として、〓ＤＤＢＪデータベース構築のための計算機資 源、〓各種検索解析サービスおよび独自サービス構築提供のための計算機資源 、〓所外研究者に計算機能力を提供するための計算機資源の３つをほぼ均等に 配備してきた。　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　 　　　本システムは、過去５年間にわが国および世界の生命科学研究が大きな 転換期を迎えているのを受け、現行のＤＤＢＪ構築事業を継続しつつ、生物科 学研究の新しい動向に対応したデータ構築業務及びサービスの提供を行うため に導入するものである。　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　 　（５）　導入予定時期　平成２３年度２月以降　　　　　　　　　　　　　 　（６）　調達に必要とされる基本的な要求要件　　　　　　　　　　　　　 　　Ａ　本システムは、スーパーコンピュータ、大容量外部記憶装置、Ｗｅｂ 公開系・ＤＢ構築系サーバー群およびネットワーク装置から構成されること。 　　Ｂ　スーパーコンピュータは複数の計算ノードを回路網で接続した分散記 憶型並列計算機であること。計算ノードは、異なるＣＰＵ数、メモリサイズ、 ローカルディスクサイズを有する３つのクラス（ｔｈｉｎ、ｍｅｄｉｕｍ、ｆ ａｔ）の計算ノード群によって構成されること。ノード単体あたりの理論ピー ク性能が１４４ＧＦＬＯＰＳ（倍精度浮動小数点演算）以上であり、クラスタ はＧＰＧＰＵを除いた理論ピーク性能の総和が１７２ＴＦＬＯＰＳ（倍精度浮 動小数点演算）以上であること。　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　 　　Ｃ　全てのノードにおいては同バージョンのＬｉｎｕｘが動作すること。 ノード内のすべてのＣＰＵはｘ８６―３２およびｘ８６―６４ビットの命令体 系を有すること。ノード間を結ぶ回路網のデータのインジェクションバンド幅 は４０Ｇｂｐｓ以上とすること。また、全体のネットワークのバイセクション バンド幅は（インジェクションバンド幅×ノード数）／２以上であること。　 　　Ｄ　Ｆａｔ計算ノードは合計３２コア以上のｘ８６―６４ビットＣＰＵコ アを持つこと。計算ノード単体あたり１ＴＢ以上の主記憶を持つこと。ノード ごとに８ＴＢ以上の磁気ディスクドライブを備えること。クラスタ全体として Ｆａｔ計算ノードを２個以上備えること。　　　　　　　　　　　　　　　　 　　Ｅ　Ｍｅｄｉｕｍ計算ノードは合計１２コア以上のｘ８６―６４ビットＣ ＰＵコアを持つこと。計算ノード単体あたり９６ＧＢ以上の主記憶を持つこと 。ノードごとに４００ＧＢ以上のＳＳＤを備えること。ＳＳＤの合算リード性 能は４００ＭＢ／ｓ以上、ライト性能は１４０ＭＢ／ｓ以上であること。計算 ノード全体の３０％以上をＭｅｄｉｕｍ計算ノードとすること。　　　　　　 　　Ｆ　Ｔｈｉｎ計算ノードは合計１２コア以上のｘ８６―６４ビットＣＰＵ コアを持つこと。ノードあたり４８ＧＢ以上のＣＰＵメモリを持つこと。ノー ドごとに４００ＧＢ以上のＳＳＤを備えること。ＳＳＤの合算リード性能は４ ００ＭＢ／ｓ以上、ライト性能は１４０ＭＢ／ｓ以上であること。Ｔｈｉｎ計 算ノードの約１５％に１ＴＢ以上のＳＳＤを搭載すること。　　　　　　　　 　　Ｇ　Ｔｈｉｎ計算ノードの約１５％にＧＰＧＰＵを１本以上搭載すること 。ＧＰＧＰＵの性能は、チップ当たりの単精度のピーク性能が１ＴＦＬＯＰＳ 以上、倍精度のピーク性能が５００ＧＦＬＯＰＳ以上とすること。これはＰＣ Ｉ　Ｅｘｐｒｅｓｓ　Ｇｅｎ−２×１６のフルバンド幅でＣＰＵや他Ｉ／Ｏに 接続されること。将来の拡張に備えて、全てのＴｈｉｎ計算ノードおよびＭｅ ｄｉｕｍ計算ノードはＧＰＧＰＵの装着スロットを２つ以上有することが望ま しい。　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　 　　Ｈ　大容量外部記憶装置は、ＲＡＩＤ６などの三重冗長性を確保して有効 記憶容量を１０ＰＢ以上有すること。また、運用時において、全てのノードを 結線するスイッチ群から全てのディスクコントローラへの物理的なデータアク セスに対し冗長性を有すること（ディスクコントローラから物理ディスクまで のデータパスは除く）。大容量外部記憶装置の一部は、高速かつ高信頼な並列 型共有ファイルシステムにより、全てのサーバから高速にアクセス可能なこと 。このファイルシステムを含む、全てのファイルシステムは動的にフェイルオ ーバーする冗長性を有すること。　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　 　　Ｉ　計算ノードと共有ファイルシステム間の物理入出力性能は、全ノード 合計で１２０ＧＢ／ｓ以上であること。これはファイルシステムへアクセスす るのに必要なすべての構成部品（二次記憶コントローラ、ネットワーク等）を 考慮した性能である。考慮しない場合の物理入力性能は全ノード合計で２４０ ＧＢ／ｓ以上であること。　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　 　　Ｊ　一部階層ストレージ管理機能を利用し、記憶容量の５０％以下をＭＡ ＩＤやテープ等で補う構成での提案を許容し、資料を招請する。この際にＭＡ ＩＤやテープ等から共有ファイルシステムへの転送速度が５ＧＢ／ｓ以上であ ること。　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　 　　Ｋ　ＤＤＢＪデータベース構築に必要な分散ＲＤＢシステムをＴｈｉｎ計 算ノード上で稼働させるため、２０ＴＢ以上のＲＡＩＤ６構成のディスクを４ 式以上持つこと。　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　 　　Ｌ　Ｔｈｉｎ計算ノードのうちの一部を用いて、ＤＤＢＪホームページ、 キーワード検索、ＷｅｂＡＰＩを提供することができるように、〓適切なセキ ュリティ管理が行えること〓２０ＴＢ以上のＲＡＩＤ６構成のディスクを２式 以上持つこと。　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　 　　Ｍ　ネットワーク装置は、外部に対してはＳＩＮＥＴ４に対して４０Ｇｂ ｐｓ以上で接続可能とすること。　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　 　　Ｎ　Ａｓｐｅｒａなどの高速なデータ転送機構を有すること。　　　　　 　　Ｏ　ＰＵＥ（Ｐｏｗｅｒ　Ｕｓａｇｅ　Ｅｆｆｅｃｔｉｖｅｎｅｓｓ）　 を年平均１．４以下にするような省電力機構を提案すること。　　　　　　　 　　Ｐ　停電発生時に上記スーパーコンピュータ及び大容量ストレージシステ ムを安全にシャットダウンできるだけの容量のＵＰＳ装置を備えること。　　 ２　資料及びコメントの提出方法　上記１（２）の物品に関する一般的な参考 資料及び同（６）の要求要件等に関するコメント並びに提供可能なライブラリ ーに関する資料等の提供を招請する。　　　　　　　　　　　　　　　　　　 　（１）　資料等の提供期限　平成２２年１１月５日 (2010年11月5日)１７時１５分（郵送の場 合は必着のこと。）　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　 　（２）　提供先　〒４１１―８５４０三島市谷田１１１１ 📍　大学共同利用 機関法人　情報・システム研究機構　国立遺伝学研究所管理部研究推進課調達 チーム　植松　昌志　電話０５５―９８１―６７３０　　　　　　　　　　　 ３　説明書の交付　本公表に基づき応募する供給者に対して導入説明書を交付 する。　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　 　（１）　交付期間　平成２２年９月１３日 (2010年9月13日)から平成２２年１１月５日 (2010年11月5日)まで。 　（２）　交付場所　上記２（２）に同じ。　　　　　　　　　　　　　　　 ４　説明会の開催　本公表に基づく導入説明会を開催する。　　　　　　　　 　（１）　開催日時　平成２２年９月２９日 (2010年9月29日)１５時００分　　　　　　　　　 　（２）　開催場所　国立遺伝学研究所本館２階会議室　　　　　　　　　　 ５　その他　この導入計画の詳細は導入説明書による。なお、本公表内容は予 定であり、変更することがあり得る。